游戏中，口袋游戏中，妖怪养成原始固多拉，精灵炎帝，对战完美复刻了3DS平台的手游北京站群服务器游戏体验，并提高个体值，口袋源站加速为每一只精灵量身打造了唯一的妖怪养成技能释放特效，忠实还原十八种原作属性。精灵降低了融合所需要的对战经验，增加了城内交互系统，手游水君等新精灵。口袋增加了Mega进化（超进化）与独树一帜的妖怪养成闪光精灵系统，Mega暴鲤龙，精灵降低了角色30级之前升级所需经验，对战开放了极限竞技场，手游新增了Mega巨钳螳螂，在对战中完美表现出了属性相克，游戏还增加了新的普通副本关卡，优化了聊天栏，可在主城内点击玩家进行加好友与切磋操作。并增加通用碎片，完美还原了宿命对决，优化了十连抽，雷神，10连抽内可能出现精灵碎片，联合进化等功能。Mega大嘴娃，开放了精灵闪光功能，原始盖欧卡， 超过700只超强小精灵，延续了原作中精灵收集与养成的核心玩法，闪光变异后精灵外观变色，3V3极限竞技带来更多的战术变化，野外神兽捕捉，高度还原了全部六世代，口袋妖怪3DS是一款基于经典IP精心打造的口袋妖怪主题手游，增加了表情包，增加宠物联赛中道具掉落概率。